中石化（大连）石油化工研究院有限公司AI辅助设计酶制剂技术平台建设生物分子模拟软件\2025版招标公告

本标在中国石化物资电子招标投标平台操作，请使用进行操作，操作流程见下方说明。

1.招标条件

本招标项目 AI辅助设计酶制剂技术平台建设生物分子模拟软件\2025版（招标编号：NWZ251010-3415-097031） ， 招标人为 中石化（大连）石油化工研究院有限公司 ， 招标项目资金来自 国有资金占主导地位 ， 出资比例为 100 % 。该项目已具备招标条件，现对 生物分子模拟软件\2025版 采购进行公开招标。

2. 项目概况与招标范围

2.1 项目概况

序号	项目名称	项目概况
1	AI辅助设计酶制剂技术平台建设	/

2.2 招标范围

序号	物资描述	数量	单位
1	生物分子模拟软件\2025版	1.000	套

3. 投标人资格要求

3.1 本次招标要求投标人须具备本款提出的资质、业绩等要求，并具有与本招标项目相应的供货能力。

3.1.1 资质要求。

（1）投标人具有营业执照、税务登记证、组织机构代码证，或按照“三证合一” 登记制度登记，执照有效。

3.1.2 财务要求。

无

3.1.3 业绩要求。

（1）业绩要求：提供近3年内（2022-2024年）同型号软件产品或类似软件产品不低于3套业绩（投标文件中必须提供合同、使用方联系方式，合同金额可抹去）。

3.1.4 信誉要求。

（1）投标人近两年内没有发生重大安全责任事故。须提供由法定代表人或授权代表签署并加盖公章的承诺书。 （2）投标人不存在被责令停产停业、暂扣或者吊销许可证、暂扣或者吊销执照；不存在进入清算程序，或者被宣告破产，或者其他丧失履约能力的情形。须提供由法定代表人或授权代表签署并加盖公章的承诺书。 （3）投标截止日投标人未被工商行政管理机关在国家企业信用信息公示系统列入严重违法失信企业名单；且未被“信用中国”网站列入失信被执行人名单；且未被中华人民共和国应急管理部政务服务平台列入安全生产严重失信主体名单。 （4）投标人未处于被中国石化给予风险停用、违约停用处理期内。

3.1.5 其他要求。

（1）蛋白质骨架设计模型应含有RFDiffusion功能，图形化交互，支持鼠标点击选取结合位点、关键作用位点。支持从头生成、骨架设计、骨架填充、自定义等多种模式。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （2）蛋白质逆折叠设计模型：包括ProteinMPNN、ESMIF、LigandMPNN等至少3种模型和方法。图形化交互，支持鼠标点击选取目标序列区域，进行可溶性蛋白、抗体、同源多聚体多种设计模式。 （3）自动化亲和力成熟流程应包含基于复合物结构的方法、基于大语言模型PLM的方法等2种方法。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （4）专利分析至少包括专利序列提取、基于全长序列进行专利序列检索等功能。 （5）蛋白质Patch分析：分子蛋白质表面的正点、负电、疏水残基富集区域的大小和分布，支持设定PH值变化修改。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （6）溶解度预测：基于序列的蛋白溶解度预测，支持不少于3种（CamSol、SoluProt、Protein-Sol）预测模型。其中CamSol：利用最直接影响蛋白质溶解度的氨基酸的物理化学特性，包括疏水性、静电荷以及它们在空间的相互作用，通过对这些特性的组合来定义溶解度分数。 （7）支持NGS测序的DNA序列分析，具体分析内容包括：IGV、IGD、IGJ基因标注（IgBlast）；DNA序列翻译为氨基酸序列，并进行CDR识别；基于蛋白语言模型，分析不常见残基及优势突变（ESM，IgLM）；PTM（翻译后修饰）风险位点分析，标记低、高风险位点；序列特征计算（等电点pI，分子量kDa，疏水性）；序列聚类分析（MMseq2）。方法不少于3种。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （8）白质语言模型进行微调，支持分类（二分类）和回归任务。提供至少三种训练方法：基于BioNeMo框架的全参微调、序列特征迁移+传统机器学习(ML)预测头、序列特征迁移+多层感知机(MLP)预测头。在默认情况下尝试所有训练方法，自动比较训练结果并选择最佳模型。训练完成后可基于训练后的最佳模型进行推理。 （9）优化mRNA序列以获得更好的密码子偏好性和更稳定的二级结构，以评估和优化其表达量和半衰期、稳定性等。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （10）支持一键提交分子动力学模拟，包括纯蛋白/核酸分子动力学模拟、蛋白-配体分子动力学模拟、纯膜分子动力学模拟、膜-蛋白分子动力学模拟、膜-配体分子动力学模拟、膜-配受体复合物分子动力学模拟等至少5种体系。 （11）强化动力学：元动力学模拟和分析。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （12）支持前端自定义功能。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （13）支持API Docs& SDK开发工具包（Python、C++、JAVA版本的SDK）：可通过多语言SDK调用 无缝接入到其他系统。 （14）支持在测试环境、开发容器环境。本项需出具相关资料证明（如截图、视频等）。 （15）支持用户批量发起签名流程，可以手动添加签名用户，也可使用系统导入工具进行批量导入用户。在批量签名流程中，支持分别查看每个子流程，每个子流程只有一位用户作为签名人，且每个子流程的文件相同，签名标签相同。 （16）提供免费的前端定制化服务，涵盖前端logo修改等。 （17）软件平台为永久使用权。 （18）投标人最终需出具《技术要求偏离表》，包含针对以上17条技术要求的逐条响应情况。

3.2 本次招标不接受联合体投标联合体投标。

3.3 本次招标接受生产商/制造商（招标物资由投标人自行生产，招标文件另有约定的从其约定）投标，不接受代理商投标。不接受流通商投标。